中国农村信用社和中国农村商业银行不一样。农村商业银行，是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。农村信用合作社（Rural credit cooperatives，农村信用社、农信社）指经中国人民银行批准设立、由社员入股组成、实行民主管理、主要为社员提供金融服务的农村合作金融机构。农村信用社是独立的企业法人，以其全部资产对农村信用社债务承担责任，依法享有民事权利。其财产、合法权益和依法开展的业务活动受国家法律保护。
农商行与信用社相比：产权制度由合作制变为股份制，股权结构和公司治理结构更加合理，股东话语权增强；农商行的监管标准要比信用社高，有利于农商行稳健可持续发展；农商行服务理念和经营模式会发生大的改变，以“客户为中心”的服务模式将全面推进；同时，产品创新的力度将会更强。
农村信用社为入股社员服务，实行民主管理，社员一人一票的农村金融合作机构。
农村商业银行的股本划分为等额股份，同股同权、同股同利的股份制地方性金融机构。
在服务重点方面，主要为辖区内农业、农民和农村经济发展服务，但由于农村商业银行是在经济相对发达地区组建，农业比重较低，因此，在满足“三农”需要的前提下，还需要兼顾城乡经济协调发展的目标。农村信用社的服务对象则更多地侧重于农户。
现今，农村信用社仍是农村金融系统的主体机构，经过金融体制改革后，一些省份已经完全转化(例江苏、安徽)或部分转化(例浙江、广东等)为农村商业银行。