1、发行主体差别。公司债是股份有限公司或有限责任公司发行的债券；企业债由中央政府部门所属机构、国有独资企业或国有控股企业发行的债券。
2、发债资金用途差别。公司债主要用途包括固定资产投资、技术更新改造、改善公司资金来源结构等；企业债主要限制在固定资产投资和技术革新改造方面。
3、市场功能差别。公司债是各类公司获得中长期债务性资金的一个主要方式；企业债受到行政机制的严格控制，发行量较少。
4、额度差别。公司债最低限大致为1200万元和2400万元；企业债发债数额不低于10亿元。
5、担保。公司债采取无担保形式，而企业债要求由银行或集团进行担保。
6、发行状况，公司债可采取一次核准，多次发行；企业债一般要求在通过审批后一年内发完。
7、审批程序。申请公开发行公司债券需要中国证监会或者国务院授权的部门核准；企业债券需要国家发展和改革委员会的审批。