40万元柜台转账不一定非得本人办理，其他人可以携带自己的身份证和他的身份证代为办理。
40万元转账属于大额交易，用户最好是携带本人身份证前往办理，不要代办。根据《中国人民银行文件》规定：落实《金融机构大额交易和交易报告管理办法》有关规定，进一步健全大额交易可疑交易报告工作机制，提高资金监测有效性。 也就是说用户转账40万元将会被银行监测资金流向，所以用户还是本人前往银行办理比较好，能避免不必要的麻烦。央行对大额交易监测主要是为了防止客户在交易中涉及洗钱、恐怖融资等犯罪活动。银行将不论所涉资金金额或者资产价值大小，应当提交可疑交易报告。
央行对于可疑交易的界定为：短期内资金分散转入、集中转出或集中转入、分散转出；资金收付频率和金额与企业经营规模明显不符；资金收付流向与企业经营范围明显不符；企业日常收付与企业经营特点明显不符；周期性发生大量资金收付与企业性质、业务特定明显不符；相同首付款之间短期内频繁发生资金收付等。