办理ETC卡的坏处：可能出现追尾现象；办理过程较为繁琐；增加ETC保养费用的支出。在用户正常使用ETC卡的情况下，ETC卡的优点大于缺点。ETC卡最大的缺点就是办理过程较为繁琐，需要提交较多的材料，办理时间较长。
办理ETC卡可能会出现追尾现象。ETC高速通道无人收取费用，ETC用户可以实现不停车过路。这本该是ETC卡的好处，但也是ETC卡的坏处。有些车主的素质还有待提高，会出现紧随ETC车辆通行，不缴纳过路费的情况。
由于高速通道的栏杆落地较快，所以后车会以较快的速度跟随，这就导致的追尾事件的产生。一旦产生追尾事件，就会耽误用户大量的时间，增加不必要的麻烦。所以很多车主喜欢走人工通道，因为人工通道有工作人员的监管。
一般情况下，ETC卡设备的质保期是两年。在两年内ETC卡设备出现了任何非人为损坏的情况，可以前往发放ETC卡设备的单位免费更换ETC设备，但是两年后，用户需要支付ETC设备维修费。
由于家庭自用车上高速的次数不多，ETC设备闲置时间较长，不排除通电后灰尘产生击穿电流损害ETC设备的情况。