1、赔付条件不同：重疾险指的是重大疾病，比如恶性肿瘤、急性心肌梗塞、脑中风后遗症，出现这些疾病的时候，往往需要较高的治疗费用，在达到合同约定疾病、疾病状态或手术条件，定额赔付；百万医疗险保障的内容主要有床位费、膳食费、护理费等，在报销的时候，主要是凭借着发票实报实销。
2、保障期不同：在这一方面，重疾险的保障期相对于医疗险的保障期较长。一般来说，重疾险的保障期在20年或者30年，保龄有60—80岁不等，甚至可以保终身。而百万医疗险最长只保1年，最大的风险就是停售。
3、保费不同。由于百万医疗险和重疾险在赔付条件和保障期间等方面存在很大的不同。因此，在保费方面也是存在很大出入的。通常的情况下，重疾险根据特定保障期间进行的定价，测算保费；而百万医疗险根据特定年龄阶段进行的定价，而且每年还可以根据实际赔付情况调整费率。所以，这一方面还是需要投保人搞清楚的。