在银行柜台是可以办理跨行转账的；如果是同城跨行转账，一般可以实时到账，如果异地跨行转账，一般会在2个小时内到账，在跨行转账时需要准确填写收款人、开户行、账号等信息。
银行柜台跨行转账需要手续费，不同的银行收费标准是不一样的，具体可以电话咨询银行；比如建设银行通过柜台跨行转账在5000元以下会收取手续费2元，5000元到10000元会收取10元手续费。这样看通过银行柜台转账成本比较高。
除了在银行柜台可以跨行转账，还可以通过ATM机、手机银行、网上银行等，通过这些途径跨行转账可以享受一定的优惠，一般是银行柜台的50%；需要注意的是，使用ATM机进行跨行转账需要24小时以后到账。
跨行转账通过ATM办理，在输入密码时一定要注意遮挡，防止密码泄露，而且转账时最好在白天进行，尽量不要在晚上办理，尤其女生，不过可以找自己的好友陪伴，在转账前要确定ATM机没有异常。