任何的投资都是会存在风险的，因此，债券基金同样也是。但是，从风险上来看的话，债券基金的风险比货币基金略高，而比股票基金和混合基金要低，属于一种稳健型的基金。当然，这类基金的回报率也不是太高。
债券基金主要分为两大类，分别是纯债券型基金与偏债劵型基金。如果从这两者来看的话，偏债型基金由于投资股票的比例相对较大，因此，它的风险要大于纯债型基金的。但是，债券基金的主要投资对象是国债、企业债、金融债或者一些短期的融资债券。虽然发行人和投资者之间是一种债权的关系，也是会存在一定违约风险的。比如企业债，许多的企业通过发行债券来进行融资，到期之后，由于企业自身问题，出现了债券违约，不能还本付息。这就出现了债券的信用风险，由此，债券基金就会面临风险的威胁。
除了信用风险之外，还有利率风险、管理风险等。因为债券基金主要投资的是债券市场，因此，利率波动会影响债券的价格和收益。这一方面主要会影响到发行人在发行债券的成本，毕竟债券需要到期后还本付息。当然，债券基金也有一小部分投资于股票，利率的变化也会影响到股票市场的走势，从而影响收益。因此，这个风险也是需要注意的。
管理风险是大部分基金都会存在的，这就关系到了基金管理人的专业水平和技能，他们在对债券基金进行投资的时候，能否在保证本金的同时，获得收益的最大化，成为了一种存在的风险。