科创板和主板在上市标准、涨跌幅额度及上市制度等方面有明显不同。
科创板上市需要公司估计市值不能低于10亿元，而且最近两年净利润不低于5千万。另外如果公司在最近一年内营业额没有1亿元也不能在科创板进行注册上市。对于估值超过40亿元的公司，科创板还需要有经过国家相关部门审批的科研项目，并且获得一定的投资才能在科创板上市。
主板上市公司需要公司经营超过3年，累计净利润超过3亿元。最近3年处于盈利状态，发行前股本总额不低于3千万。主板正常股票有着10%的涨跌幅限制，对于ST股则有着更加严格的5%限额。而科创板涨跌幅度的限额比较大，新上市的科创股票前5个交易日不设置涨幅限额，5日以后涨跌幅度限额为20%。
科创板上市采取注册制度，而主板的上市采取核准制度。在主板上市必须要符合上市的各种硬性规定，然后由证监会的新股发审委决定能否上市。科创板允许尚未实现盈利的公司上市，这些公司往往因为公司的前景不明朗导致存在较大风险。