基因检测只采集唾液,最后的结果能靠谱吗?




最近参加了滴滴专车做的一个基因检测活动,他们做检测只是收集了我的唾液。想问一下,收集唾液这种方式来检测基因靠谱吗?只收集了唾液,万一过程中有点什么污染之类的,最后的结果真的会准确吗?总觉得这种方式是不是有点太儿戏了……





除非癌症突变或者生殖细胞精子或者卵子,正常人身体上的每个细胞都内都有每个人全部的30亿个DNA代码。虽然血液是最可靠的人体DNA来源,但是却不是最方便的DNA来源。因为抽血必须由专业医务人员操作,而且需要严格消毒防止感染。同时血液也不能在常温下运输很容易变质。相反唾液是很好的替代方法,唾液采集非常方便,而且唾液可以很方便的进行常温运输不变质。唾液采集DNA并不是唾液本身的DNA,而主要是唾液中脱落的口腔上皮细胞。所以通过唾液采集DNA之前需要用舌头搅动口腔壁,保证有更多的上皮细胞脱落。 唾液中72%的DNA都与血液中的DNA一样来源于白细胞。

但是用唾液提取DNA也有比较大的挑战,主要问题是细菌污染和DNA的降解。口腔中的细菌要远远大于血液,所以一般基因检测收集唾液的时候都要求半小时之前不能吃东西和吸烟等,这样可以尽量保持口腔最大限度的干净。同时口腔中的酶会让DNA降解更快。现在唾液采集管子里面都会有保存液,主要作用是抑制细菌繁殖和稳定DNA防止降解。偶尔有用户DNA不合格只需要重新采集就可以了。23魔方数据显示在DNA细菌污染的用户中,男性大大高于女性,可能是因为男性用户没有女性用户口腔卫生好吧。

总的来说,通过唾液采集DNA是非常方便经济的方法,只要有比较好的DNA保存液采集成功率非常高。就算偶尔有细菌污染和DNA降解在检测完成后的质量控制流程都会发现,不会给用户产生错误数据。




参考:

Can saliva replace blood for DNA collection & analysis? (Part 1 of 3)




唾液做基因检测没问题,口腔拭子采样用来做PCR和质谱都是很常见的。

唾液做基因检测的关键不在于唾液中的DNA质量和数量,这跟血液没什么太大差异,其他几位也都说了。但就像 @王勉 引用的DNA Genotek公司的文章[1]里说的那样:

”However, the major issue with saliva DNA arises when naturally degrading enzymes and bacteria within the sample attack DNA integrity and decrease quality very quickly.“

“但是,唾液DNA的主要问题是样本中的自然降解酶和细菌会破坏DNA的完整性,很快降低DNA的质量。“

换句话说,采集不难,检测也行,麻烦的是保存。

DNA Genotek通过一些保存方法,使得大部分其中所保存的DNA片段长度大于23kb,平均细菌含量11.8%。illumina,Affymetrix(已被Thermo Fisher收购),Complete Genomics(已经被华大基因收购)几家公司分别测试DNA Genotek的唾液采集管在自己的基因芯片或测序平台上的效果,表示跟血液没什么区别。

当然,这都是DNA Genotek自家产品的测试结果,并不是所有的唾液采集管都能做到文章中所说的效果。

最近刚刚看了一份某品牌唾液采集管保存样品在Hiseq X Ten上的全基因组测序数据,有点惨不忍睹。。。做口腔微生物的效果估计挺好的。。。

[1]: Can saliva replace blood for DNA collection & analysis? (Part 1 of 3)




这里还有一个相关的问题:作为一个基因检测公司选择一个好的唾液DNA采集器?