主要有三个特点：(1)时效性：因为冷链物流所承载的产品都是不易储存，而且是易腐烂的。因此，冷链物流必须在短时间内完成作业，以保证产品不会出现任何的问题。
(2)复杂性：与常温物流相比，冷链物流涉及到制冷技术、保温技术、温湿度检测、信息系统和产品变化机理研究等技术，有的产品甚至涉及到法律法规的约束，且每种产品均由其对应的温湿度和储藏时间要求，一旦断链将会造成前面的努力白费，因此大大加大了冷链物流的复杂性。
(3)高成本性：冷链物流的成本远比常温物流投入要高。首先是设备成本较高，冷链物流中心仓库和冷链车辆的成本一般是常温仓库和车辆的数倍，而且因涉及到食品等需要特殊的设施设备，需要大量的资金投入;其次冷链物流运营成本较高，冷库需要不间断的打冷才能保证温度处于恒定状态，造成冷库的电力成本居高不下;冷藏车也需要不间断打冷才能保证产品的温度恒定，就需要更多的油费。冷链物流资本回收期较长，不是一般的企业所能承担。