余额宝提现超过免费额度是需要手续费的。根据支付宝的收费规则，每年每个账户有2万元的免费提现额度，如果超过会按照0.1%进行收取。因此，不论是余额宝还是支付宝，超过额度都是要收取手续费的。
除了提现之外，使用支付宝进行消费、理财、购买保险、手机充值、水电煤缴费、挂号、缴纳交通罚款、使用手机支付宝转账到支付宝账户、还款等服务不受任何影响，用户免费使用的同时还可以获得蚂蚁积分，在用完免费额度后，用户累积的蚂蚁积分可以用于兑换免费提现额度。支付宝方面介绍，目前兑换比例是，1个蚂蚁积分可以兑换1块钱的免费提现额度，上不封顶。