1、信用风险：农户联保贷款户多、额度大，且大都是由五户以上农户组成联保小组进行互相担保，一般是以联保小组成员的信用作基础，没有可变现的有效资产作抵押，一旦出现风险，难以得到有效抵偿。
2、农户不按期还款：在贷款历程中，通常农户还贷意识不强、法制意识淡薄，联保小组成员贷款不能按期偿还，另外的成员不愿代为清偿。银行除了运用法律手段外别无他法。
3、风险集中：向来银行在投放贷款历程中，会在同一时间、同一地域投放，而他们从事的生产经营项目相同或相近，一旦遇到经营风险向来谁也逃脱不了劫难，特别是种养业受自然灾害、疫情等因素影响大、风险集中，增加了银行经营风险。